More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3201 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  100 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  95.17 
 
 
207 aa  340  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  95.17 
 
 
207 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  95.17 
 
 
207 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  95.17 
 
 
207 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  95.17 
 
 
207 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  95.17 
 
 
207 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  94.69 
 
 
207 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  71.23 
 
 
215 aa  268  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70.89 
 
 
215 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  73.68 
 
 
211 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  57.5 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  48.56 
 
 
211 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  53.4 
 
 
208 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  48.54 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.72 
 
 
211 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  50.72 
 
 
210 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.24 
 
 
211 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  48.31 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.86 
 
 
207 aa  148  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.47 
 
 
204 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.75 
 
 
208 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  48.04 
 
 
215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 
208 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  31.79 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  41.67 
 
 
240 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 
213 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0202  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.88 
 
 
159 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.38 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  34.58 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.32 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.76 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  36.47 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  36.47 
 
 
208 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  36.47 
 
 
208 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  36.88 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.03 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.88 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  36.88 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  36.47 
 
 
242 aa  91.7  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  32.41 
 
 
215 aa  91.3  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0692  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.84 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5301  lysine exporter protein LysE/YggA  32.75 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.03 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  35.84 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 
216 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  41.91 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.1 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  40.88 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  35.81 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  40.27 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
205 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  31.4 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.04 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  31.02 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  30.46 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  31.02 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  30.56 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  33.53 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.67 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4624  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.629112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.27 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.76 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.58 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.81 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  30.56 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  30.56 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.85 
 
 
219 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  31.02 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  33.15 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  31.28 
 
 
211 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  31.28 
 
 
211 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  31.28 
 
 
211 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  31.28 
 
 
211 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
211 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.15 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.57 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  38.93 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.34 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>