More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5434 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 240 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70 
 
 		 204 aa  299  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  58.47 
 
 		 206 aa  248  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  50.85 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  52.54 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.29 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.43 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  46.19 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  50 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  45.92 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.22 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.4 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  37.66 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 		 204 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  40.5 
 
 		 207 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  40.5 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  40 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  40 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  40 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  40 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.67 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  41.5 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.81 
 
 		 215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.47 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  34.89 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.19 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.06 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  41.45 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  34.19 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.29 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  38.39 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.4 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.09 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  36.25 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.27 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  39.5 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.65 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.13 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  34.32 
 
 		 203 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  34.19 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.8 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.19 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.88 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  32.76 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.56 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  35.34 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.8 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.8 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  36.61 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 205 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.22 
 
 		 206 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  31.67 
 
 		 205 aa  95.5  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0202  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 		 159 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.76 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  36.16 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  36.16 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  36.28 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.36 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 205 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.29 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  28.51 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  31.93 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 210 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.64 
 
 		 206 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  33.76 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  32.9 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  31.76 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  28.16 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.96 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  28 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.96 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  33.05 
 
 		 206 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  29.71 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  29.71 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.13 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.71 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  29.71 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.71 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.71 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.71 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3717  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 217 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  38.22 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  34.96 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  34.7 
 
 		 207 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  34.96 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.71 
 
 		 206 aa  88.2  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  30.8 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 208 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.29 
 
 		 206 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4299  lysine exporter protein LysE/YggA  34.19 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>