More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2151 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 230 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.26 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  31.74 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  33.04 
 
 		 207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.33 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.61 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  32.17 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  30.87 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  35.06 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  34.11 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.61 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.74 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  32.17 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 		 205 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.09 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  33.33 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  37.85 
 
 		 205 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.09 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.16 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  34.21 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.04 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  33.77 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 206 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  33.77 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  33.48 
 
 		 203 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  31.3 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  33.62 
 
 		 203 aa  85.9  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 203 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  31.3 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  31.3 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.57 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  31.7 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.44 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  30.87 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.39 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  32.14 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  27.19 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  28.07 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  22.71 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.09 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0980  hypothetical protein  30.54 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00272416  normal  0.0487785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.07 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2641  hypothetical protein  29.57 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.774137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.51 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.38 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  28.88 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.63 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  28.38 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  28.38 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.38 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.38 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.07 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  27.01 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  33.78 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  34.01 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0964  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0177449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  28.19 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.38 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  28.38 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.38 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.05 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.05 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  28.76 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.05 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  28.7 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  32.65 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.76 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  32.65 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  32.65 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  32.65 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  32.65 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  32.65 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.48 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  25.76 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  27.6 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  32.87 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.91 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.86 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  28.21 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.91 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  34.84 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>