More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4624 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4624  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 213 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.629112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  53.3 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.3 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.11 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.45 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  38.17 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.39 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.88 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  39.05 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.18 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.21 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.21 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.16 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  36.97 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.84 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.68 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  34.09 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.98 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.65 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.58 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.55 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  36.89 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.49 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  38.16 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.02 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.64 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.37 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.27 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.27 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.27 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.27 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  35.08 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.45 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.05 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.27 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.27 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.74 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.27 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  40.21 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.12 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.9 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  38.04 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.06 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  41.45 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.52 
 
 		 216 aa  95.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  40.27 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  38.89 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2352  lysine exporter protein LysE/YggA  43.27 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  31.75 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.62 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  37.42 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  37.42 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  37.42 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  35.21 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  37.42 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  37.42 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  33.5 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2171  amino acid transporter LysE  30 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  25.98 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.21 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.22 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  29.72 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  36.71 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  35.14 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  35.14 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3569  lysine exporter protein LysE/YggA  28.99 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.96 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  31.93 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  31.48 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.39 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>