More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5301 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5301  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 209 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  99.04 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  99.04 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0692  lysine exporter protein LysE/YggA  96.65 
 
 		 209 aa  362  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  45.1 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  42.38 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.97 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.85 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.15 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  36.15 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  34.4 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  38.76 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  33.78 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  33.78 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  35.27 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.93 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.89 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.21 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.99 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.46 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.58 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 217 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  30.99 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  30.99 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.99 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.99 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.99 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.99 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  30.99 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.99 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  36.89 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.99 
 
 		 206 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.52 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.52 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.52 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.01 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.29 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  31.88 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.18 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.41 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  32.94 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3922  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.97 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  36.13 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  28.37 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  35.41 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.47 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 213 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  32.37 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  26.92 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  33.71 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  26.92 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.88 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.29 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.95 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  27.4 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  31.18 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.27 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  29.15 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>