More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0712 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1569  LysE family protein  100 
 
 
204 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0712  LysE family translocator protein  100 
 
 
204 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2032  LysE family translocator protein  100 
 
 
204 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0810  LysE family protein  90.87 
 
 
241 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87054  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0610  LysE family protein  97.6 
 
 
208 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2203  LysE family translocator protein  97.12 
 
 
208 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987401  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2117  LysE family protein  96.63 
 
 
208 aa  284  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  74.04 
 
 
208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  74.04 
 
 
206 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  74.04 
 
 
206 aa  278  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  74.04 
 
 
206 aa  278  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  72.6 
 
 
207 aa  275  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  68.54 
 
 
213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  68.42 
 
 
218 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  74.04 
 
 
207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  67.28 
 
 
217 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  73.08 
 
 
207 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5673  lysine exporter protein LysE/YggA  47.03 
 
 
211 aa  148  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5121  hypothetical protein  47.03 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58500  hypothetical protein  47.03 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0506  lysine exporter protein LysE/YggA  45.54 
 
 
205 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.82 
 
 
208 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.62 
 
 
223 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.89 
 
 
209 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 
210 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 
210 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 
232 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.32 
 
 
211 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 
210 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  34.13 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  33.17 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.69 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  41.13 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.99 
 
 
211 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  33.17 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  38.04 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.85 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.85 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  38.04 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 
212 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.96 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  38.12 
 
 
204 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  38.12 
 
 
204 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  37.91 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.49 
 
 
210 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  37.91 
 
 
204 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  36.36 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14510  putative threonine efflux protein  38.16 
 
 
211 aa  94  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93793  normal  0.0749541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  37.36 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.68 
 
 
288 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.68 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  37.36 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.98 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  35.4 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
227 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  40.41 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  40.41 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  40.41 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  40.41 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  30.62 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  36.96 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  42.86 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  42.86 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  42.86 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  42.86 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  42.86 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.38 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  42.86 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  42.86 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  32.66 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  36.59 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  39.1 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  39.1 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>