More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0333 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 210 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  86.67 
 
 		 210 aa  351  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  68.57 
 
 		 210 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  69.05 
 
 		 210 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  68.57 
 
 		 210 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  68.42 
 
 		 213 aa  294  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  70.48 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  69.52 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.1 
 
 		 210 aa  288  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.1 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  68.1 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  69.52 
 
 		 210 aa  284  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.57 
 
 		 210 aa  284  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  67.62 
 
 		 210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  66.67 
 
 		 211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.29 
 
 		 210 aa  281  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  67.62 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.88 
 
 		 211 aa  275  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  67.14 
 
 		 215 aa  274  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  67.46 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  66.19 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  66.67 
 
 		 215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  66.67 
 
 		 215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  66.51 
 
 		 234 aa  270  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  66.19 
 
 		 210 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  69.43 
 
 		 194 aa  267  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  66.19 
 
 		 210 aa  260  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  66.17 
 
 		 209 aa  255  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.86 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  60.95 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.24 
 
 		 215 aa  234  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  59.79 
 
 		 212 aa  234  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  61.11 
 
 		 215 aa  232  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  56.37 
 
 		 212 aa  218  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  56.25 
 
 		 211 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  52.38 
 
 		 229 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  51.9 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  52.86 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  52.38 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  51.9 
 
 		 215 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  51.9 
 
 		 215 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.63 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.07 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.45 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.5 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  38.76 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  39.53 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  38.43 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  38.43 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.29 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.57 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  34.76 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.63 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.19 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.67 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.79 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  33.49 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  39.72 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.53 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.07 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.07 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.07 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.07 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.07 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.07 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.07 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.35 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.6 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  38.2 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  43.03 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.52 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  38.5 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.5 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  42.42 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.48 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.91 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  34.56 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.89 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.07 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  38.69 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.25 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  28.42 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.26 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  37.35 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.81 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>