More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0680 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  100 
 
 
207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  71.43 
 
 
204 aa  288  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  66.34 
 
 
203 aa  281  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  73.17 
 
 
203 aa  274  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  66.34 
 
 
204 aa  262  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  53.17 
 
 
205 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  57.84 
 
 
204 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238287  normal  0.209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  54.68 
 
 
202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3213  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.07 
 
 
204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  52.45 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  52.94 
 
 
205 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.23 
 
 
205 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2814  lysine exporter protein LysE/YggA  53.85 
 
 
204 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0715917  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  54.9 
 
 
220 aa  208  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.45 
 
 
203 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  59.26 
 
 
203 aa  205  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  51.47 
 
 
203 aa  204  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  55.83 
 
 
204 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  53.72 
 
 
205 aa  201  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0505  lysine exporter protein LysE/YggA  51.46 
 
 
210 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.32 
 
 
203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1665  RhtB family transporter  52.45 
 
 
202 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0298  lysine exporter protein LysE/YggA  51.96 
 
 
202 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 
203 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.75 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  40.98 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  33.01 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  38.81 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  38.31 
 
 
204 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  38.31 
 
 
204 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
204 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
204 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 
204 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  38.12 
 
 
204 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 
207 aa  121  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.3 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 
204 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  37.31 
 
 
194 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  37.31 
 
 
194 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  37.31 
 
 
194 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  37.31 
 
 
194 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
204 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
227 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  37.25 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  37.25 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  37.25 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  37.25 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.25 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  37.25 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  37.25 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.75 
 
 
204 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.56 
 
 
208 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.75 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.2 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.38 
 
 
215 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.89 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.12 
 
 
218 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.83 
 
 
209 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.68 
 
 
206 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
207 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.05 
 
 
208 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  37.32 
 
 
211 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0418  transport transmembrane protein  39.41 
 
 
206 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.55 
 
 
216 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
213 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.87 
 
 
214 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  42.45 
 
 
206 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
207 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  35.15 
 
 
206 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 
218 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.32 
 
 
206 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 
209 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.15 
 
 
207 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  30.69 
 
 
213 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
213 aa  101  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 
211 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  33 
 
 
205 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.73 
 
 
217 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
211 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 
213 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 
217 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.96 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.13 
 
 
216 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 
211 aa  98.6  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  34.83 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  33.67 
 
 
208 aa  97.8  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.35 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  34.34 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>