More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0887 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  65.85 
 
 
203 aa  270  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  65.85 
 
 
205 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  69.76 
 
 
204 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238287  normal  0.209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.44 
 
 
203 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  69.76 
 
 
220 aa  258  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  67.88 
 
 
203 aa  251  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2814  lysine exporter protein LysE/YggA  66.34 
 
 
204 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0715917  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  60.98 
 
 
203 aa  244  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  59.9 
 
 
202 aa  241  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3213  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  63.86 
 
 
204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  52.68 
 
 
205 aa  214  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.41 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  54.63 
 
 
204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  54.23 
 
 
207 aa  207  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.66 
 
 
204 aa  205  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  53.96 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  52.68 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  52.13 
 
 
205 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0298  lysine exporter protein LysE/YggA  55.22 
 
 
202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.8 
 
 
203 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1665  RhtB family transporter  54.73 
 
 
202 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0505  lysine exporter protein LysE/YggA  50.74 
 
 
210 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
206 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 
206 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  39.3 
 
 
204 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 
204 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 
204 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  34.38 
 
 
208 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  38.81 
 
 
204 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39 
 
 
206 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  38.81 
 
 
204 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 
208 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 
204 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
204 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  37.31 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  38.31 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  37.86 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.5 
 
 
205 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 
208 aa  115  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.82 
 
 
208 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.16 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.44 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  34.16 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  36.82 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.16 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  36.82 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  36.82 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  36.82 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.83 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.66 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.66 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.66 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.66 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.76 
 
 
208 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.52 
 
 
206 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.86 
 
 
211 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
209 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.49 
 
 
205 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.62 
 
 
218 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  31.55 
 
 
215 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.83 
 
 
207 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.14 
 
 
218 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
218 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.65 
 
 
211 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 
211 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.98 
 
 
219 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
211 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  31.47 
 
 
205 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0418  transport transmembrane protein  37 
 
 
206 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 
211 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 
213 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 
211 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 
213 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.63 
 
 
208 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  32.63 
 
 
206 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.49 
 
 
206 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  32.49 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  32.49 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.49 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  29.84 
 
 
213 aa  99  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
212 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  32.49 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.49 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.49 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.49 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.32 
 
 
209 aa  99  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.99 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.87 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
216 aa  98.2  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>