35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0833 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0833  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 221 aa  421  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03425  hypothetical protein  57.34 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1015  lysine exporter protein LysE/YggA  54.34 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.486476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.91 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0991  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.91 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0472  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.31 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.464761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  29.05 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  29.05 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  27.01 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  28.37 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  27.14 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  28.37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  26.28 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.66 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  32.19 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  27.66 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  26.4 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  24.14 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  27.66 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  26.95 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  30.89 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.34 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  27.14 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  31.51 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  26.43 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  22.99 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  27.14 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.41 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.41 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  22.93 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  24.88 
 
 		 229 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>