67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0991 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0991  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.85 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0472  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.24 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.464761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03425  hypothetical protein  31.05 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1015  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.486476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.21 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0833  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.41 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  31.85 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  31.21 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  33.58 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  33.58 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  32.85 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  34.07 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  32.85 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  32.85 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  32.85 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  23.53 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  32.85 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  32.12 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  25.96 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  29.66 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.27 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  29.51 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  30.19 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  29.58 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  30.88 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  26.37 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.76 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  23.03 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04850  hypothetical protein  25.51 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.85439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  21.94 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  26.23 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  27.12 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.23 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  26.23 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  20.79 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.36 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  24.34 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  23.94 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  27.42 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  25 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  24.49 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  24.87 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  21.88 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  20.98 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  24.49 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  24.49 
 
 		 223 aa  42  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  24.49 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  22.99 
 
 		 212 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.34 
 
 		 208 aa  42  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.19 
 
 		 242 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  24.49 
 
 		 223 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  24.49 
 
 		 223 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  23.39 
 
 		 221 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  22.45 
 
 		 213 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  20.57 
 
 		 213 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  22.5 
 
 		 209 aa  42  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  24.49 
 
 		 223 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.28 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.06 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  22.16 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  22.75 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>