42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2516 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 208 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  53.5 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  54.04 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  51.26 
 
 		 208 aa  194  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  45.67 
 
 		 218 aa  177  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  45.05 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.78 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.63 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30.13 
 
 		 246 aa  91.3  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  30.69 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  30.16 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.54 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 273 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  25.51 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  26.46 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.88 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  30.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.13 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  25.99 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  25.42 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  24.63 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.37 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  24.14 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  24.75 
 
 		 229 aa  45.1  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  24.14 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.16 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  23.59 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.08 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.62 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  25.9 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>