26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0708 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 219 aa  411  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  48.08 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  42.11 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  47 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  28.31 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  29.55 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  28.64 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.47 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  28.93 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  29.23 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  36.46 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  27.92 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.56 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  25.74 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.56 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.12 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>