34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0323 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
273 aa  546  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  43.02 
 
 
246 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 
219 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  67.03 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  28.41 
 
 
229 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.55 
 
 
222 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  26.25 
 
 
205 aa  95.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  24.91 
 
 
209 aa  85.9  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.36 
 
 
214 aa  85.5  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.95 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  24.31 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  27.17 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 
200 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  33.7 
 
 
218 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  23.26 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  23.26 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 
191 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  31.87 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  22.53 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0517  chemotactic transduction protein ChpE  33.94 
 
 
203 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
219 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 
211 aa  45.8  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  22.22 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  32.71 
 
 
204 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  29.87 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.21 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.78 
 
 
209 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  25.66 
 
 
199 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  25.66 
 
 
199 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>