245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0517 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0517  chemotactic transduction protein ChpE  100 
 
 		 203 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  95.68 
 
 		 203 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0661  lysine exporter protein LysE/YggA  62.81 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  hitchhiker  0.00312579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  46.31 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  47.12 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.52 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  33.57 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  24.87 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  25.29 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  25.29 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  24.37 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  24.71 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.34 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.89 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  27.23 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  27.72 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  29.51 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  32.41 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  33.56 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  27.72 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  29.51 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  27.95 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  29.51 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  27.72 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  23.86 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.88 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.88 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  33.56 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  23.86 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  29.27 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  33.56 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  33.56 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  33.56 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  33.79 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  31.78 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  26.37 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  33.08 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.89 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  30.07 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.89 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  33.1 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  24.49 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  35.04 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  28.98 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  28.98 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  28.98 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.74 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  28.98 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  28.98 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  32.74 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  28.98 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  28.78 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  35.42 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  31.51 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  31.51 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  28.32 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  30.91 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  30.91 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  32.58 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  29.63 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  29.63 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  29.63 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.52 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  35.04 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  29.63 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  28.98 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  29.63 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  29.91 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  29.63 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  28.91 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  30.25 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  30.25 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  30.25 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  26.35 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.86 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  28.32 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  27.67 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  30.25 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  30.25 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  29.14 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.82 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  28.32 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  29.55 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  29.55 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  29.55 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.09 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  27.34 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>