99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3023 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  100 
 
 
225 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  99.56 
 
 
225 aa  433  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  99.11 
 
 
225 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  97.77 
 
 
224 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  95.11 
 
 
225 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  97.7 
 
 
217 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  97.7 
 
 
217 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  97.7 
 
 
217 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  85.2 
 
 
240 aa  367  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  86.04 
 
 
223 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  85.59 
 
 
225 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  85.59 
 
 
237 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  85.59 
 
 
237 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  86.94 
 
 
222 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  84.38 
 
 
221 aa  337  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3107  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.65 
 
 
225 aa  278  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552982  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0613  lysine exporter protein LysE/YggA  75.12 
 
 
226 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10064  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0887  homoserine/homoserine lactone/threonine efflux pump  73.3 
 
 
229 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  51.16 
 
 
220 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  53.55 
 
 
214 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  51.43 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  50.23 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.83 
 
 
223 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.58 
 
 
227 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.09 
 
 
227 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.79 
 
 
223 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  23.38 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.11 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  24.87 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  26.21 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  26.21 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  22.86 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  22.75 
 
 
209 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  25.96 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  25.24 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  24.76 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  24.76 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  28.81 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  28.49 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  27.57 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  27.86 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  23.91 
 
 
215 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.71 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.46 
 
 
213 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  26.46 
 
 
210 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  26.94 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  27.87 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  26.46 
 
 
210 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  26.97 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  26.46 
 
 
210 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  22.83 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  23.27 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  29.78 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  31.96 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  21.05 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  24.04 
 
 
210 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  25.74 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  31.39 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  28.07 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  26.28 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  31.39 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  26.35 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  22.77 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  22.77 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.83 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  26.84 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  26.98 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  22.77 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  22.77 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  26.98 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  22.77 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  26.98 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  26.98 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  26.32 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  21.2 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  26.98 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  26.98 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  22.77 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  29.75 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  32.12 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  32.74 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.74 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  26.83 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0517  chemotactic transduction protein ChpE  30.91 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  29.57 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.54 
 
 
226 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.91 
 
 
226 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  29.73 
 
 
224 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  31.09 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.69 
 
 
242 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  21.05 
 
 
247 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>