111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3823 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  90.74 
 
 		 217 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  61.97 
 
 		 214 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  60.75 
 
 		 220 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  53.11 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  51.43 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  51.43 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  51.43 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  50.24 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  50.24 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  51.43 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  51.43 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  51.43 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  51.43 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  51.43 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  51.43 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  50.48 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  50.72 
 
 		 221 aa  197  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  50.24 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0887  homoserine/homoserine lactone/threonine efflux pump  49.53 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0613  lysine exporter protein LysE/YggA  49.29 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3107  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.52 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.38 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.68 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.04 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  28.22 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  21.76 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  22.28 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  22.28 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  23.44 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  22.28 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  23.96 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  23.44 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  23.44 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  26.09 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  25.54 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  26.09 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  24.62 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  26.09 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  23.62 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  24.12 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  22.92 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  22.92 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  23.94 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  25.54 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  23.12 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  27.71 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  27.71 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  27.71 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  29.63 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  27.11 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  29.91 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  28.1 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  30.23 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  33.33 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.6 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  37.25 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  29.73 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  23.83 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.42 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  25.41 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  25.41 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  25.41 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  25.41 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  22.35 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.36 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  25.41 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  25.13 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  24.36 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.03 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  26.7 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  26.45 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  27.5 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  25.32 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  24.68 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.24 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  24.68 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  26.45 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  26.45 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.73 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  24.68 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  24.68 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  27.34 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  24.68 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  26.45 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  26.45 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  24.68 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  24.68 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  26.45 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  22.22 
 
 		 209 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  33.03 
 
 		 206 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  21.72 
 
 		 218 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  27.93 
 
 		 210 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>