164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0810 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 223 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  99.1 
 
 		 225 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  92.79 
 
 		 240 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  93.72 
 
 		 237 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  93.72 
 
 		 237 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  86.49 
 
 		 224 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  95.07 
 
 		 222 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  86.04 
 
 		 225 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  86.04 
 
 		 225 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  85.59 
 
 		 225 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  85.59 
 
 		 225 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  91.48 
 
 		 221 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  86.51 
 
 		 217 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  86.51 
 
 		 217 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  86.51 
 
 		 217 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0887  homoserine/homoserine lactone/threonine efflux pump  79 
 
 		 229 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3107  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.67 
 
 		 225 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0613  lysine exporter protein LysE/YggA  77.57 
 
 		 226 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  51.43 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  51.66 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  50.95 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  52.61 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.08 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.09 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.78 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.18 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  25.37 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  30.62 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  26.7 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  26.7 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.96 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.33 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  25.93 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  23.22 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  26.21 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  25.73 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  25.73 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  25.73 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  27.75 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  29.86 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  24.26 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  23.76 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  23.76 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  23.76 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  23.76 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  23.76 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  23.27 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  21.74 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  26.88 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  25.14 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  21.74 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  31.52 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  21.74 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  28.41 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  28.41 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  28.41 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  28.41 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  28.41 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  28.39 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  28.41 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  28.41 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  27.84 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  27.84 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  27.84 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  27.67 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  27.84 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  33.67 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.88 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  27.84 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  27.84 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  30.93 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  31.96 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  31.63 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  31.63 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  31.63 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  27.17 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.67 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  25.95 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  28.7 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  28.7 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  28.95 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  31.31 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  28.95 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  31.31 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  28.95 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  28.95 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  28.95 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  31.31 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>