178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4052 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
240 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  93.19 
 
 
237 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  93.19 
 
 
237 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  91.89 
 
 
223 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  91.03 
 
 
225 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  95.93 
 
 
222 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  90.05 
 
 
221 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  85.2 
 
 
224 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  85.2 
 
 
225 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  85.2 
 
 
225 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  84.75 
 
 
225 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  84.38 
 
 
225 aa  363  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  86.11 
 
 
217 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  86.11 
 
 
217 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  86.11 
 
 
217 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0887  homoserine/homoserine lactone/threonine efflux pump  76.47 
 
 
229 aa  291  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3107  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.88 
 
 
225 aa  291  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552982  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0613  lysine exporter protein LysE/YggA  78.18 
 
 
226 aa  288  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10064  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  53.11 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  52.86 
 
 
217 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  50.95 
 
 
220 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  52.86 
 
 
214 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.81 
 
 
223 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.28 
 
 
223 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.89 
 
 
227 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.89 
 
 
227 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  24.5 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 
210 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 
210 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 
222 aa  72  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  24.54 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.92 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  23.81 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  25.85 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  25.85 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  29.33 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  25.37 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  25.37 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  24.88 
 
 
208 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  24.88 
 
 
208 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  28.37 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  35.45 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  35.45 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  24.38 
 
 
210 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  23.88 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  34.69 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  23.88 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  23.88 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  23.88 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  29.49 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  23.88 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  34.55 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  34.55 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  22.4 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  33.64 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  36.51 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  23.88 
 
 
210 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  28.31 
 
 
223 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  32.52 
 
 
203 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  28.31 
 
 
210 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  34.51 
 
 
223 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  26.45 
 
 
222 aa  55.1  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  28.31 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  29.31 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  28.31 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  28.31 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  29.31 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  34.02 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  22.35 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  29.31 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  34.02 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  29.31 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  28.31 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  34.02 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  28.31 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  28.83 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  22.35 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  29.31 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  28.31 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
204 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  30.07 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  30.7 
 
 
204 aa  52  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  30.7 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  30.97 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  30.97 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  30.97 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  30.97 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  34.34 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  32.32 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  30.7 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  32.99 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  30.7 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  30.97 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0517  chemotactic transduction protein ChpE  31.58 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  34.34 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  34.34 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>