91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1656 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  90.74 
 
 		 220 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  61.03 
 
 		 214 aa  257  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  59.17 
 
 		 220 aa  248  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  52.86 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  50.95 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  50.95 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  50.93 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  49.77 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  50.71 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  50.23 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  50.23 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  50.23 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  50.23 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  50.23 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  50.23 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  50.95 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  50.23 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  50.48 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3107  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.36 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0887  homoserine/homoserine lactone/threonine efflux pump  48.39 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0613  lysine exporter protein LysE/YggA  48.13 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.88 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.38 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.27 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  23.83 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  27.17 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  23.32 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  23.32 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  23.32 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  23.44 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  22.92 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  23.44 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  23.43 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  25.53 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  22.99 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  22.99 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  22.99 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  22.99 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  22.46 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  22.4 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  22.4 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  22.46 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.09 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  27.71 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  26 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  27.71 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  21.93 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  22.46 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  27.71 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  28.1 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  21.62 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  34.88 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  29.63 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  30.63 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  21.93 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.99 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  29.46 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  23.83 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  25.83 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2364  lysine exporter protein LysE/YggA  27.57 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.07679  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  27.81 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  28.03 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  28.47 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  26.88 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  36.27 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  22.73 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  25.9 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  25.9 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  25.9 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  25.9 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  27.74 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  24.62 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  22.22 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  28.83 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.78 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.78 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  27.5 
 
 		 223 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.87 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.920689  normal  0.0700576 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 219 aa  42  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  27.93 
 
 		 210 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.73 
 
 		 239 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  25.32 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  25.95 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  28.46 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>