79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1153 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  100 
 
 		 197 aa  374  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  49.5 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  49 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  49.5 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  38.89 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  45 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 229 aa  84.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  29.61 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  28.29 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  28.29 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  28.29 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  27.8 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  27.32 
 
 		 247 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  27.8 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  27.8 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  28.64 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  29.71 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  29.71 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  30 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  29.41 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  29.41 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  29.41 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  28.88 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.16 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  28.96 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  28.34 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  28.34 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.27 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.3 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  32.05 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  27.72 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  27.17 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.24 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  27.84 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1991  lysE/yggA family protein  30.77 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.59 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1820  amino acid transporter LysE  31.07 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1989  lysE/yggA family protein  31.07 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3338  lysE/yggA family protein  30.29 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.604922  hitchhiker  0.0000000000000142617 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1803  amino acid transporter LysE  31.07 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  24.87 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2024  lysE/yggA family protein  31.07 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.37394e-48 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.31 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1848  lysE/yggA family protein  31.07 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2067  lysE/yggA family protein  29.81 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0288158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2086  lysE/yggA family protein  29.81 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000150572  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1371  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.39 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.31 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.24 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1852  lysine exporter protein LysE/YggA  29.33 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  25.62 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  24.84 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  24.84 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  26.76 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  30.33 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  23.83 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  23.83 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1015  lysine exporter protein LysE/YggA  26.85 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.486476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  23.44 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  27.91 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  29.52 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  25.62 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  24.63 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  27.04 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.04 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0991  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.37 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  26.78 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  26.45 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.17 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.08 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  27.91 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 		 207 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  25.17 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>