37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1371 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1371  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  396  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  70 
 
 		 201 aa  269  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  42.62 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.62 
 
 		 186 aa  122  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.55 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.39 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.42 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.27 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  34.15 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  34.15 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  31.9 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  35.1 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.24 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  29.33 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  29.35 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  29.35 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  25.62 
 
 		 640 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  31.01 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  26.07 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  29.85 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  31.71 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  27.07 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  28.26 
 
 		 208 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  29.55 
 
 		 210 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  30.65 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  30.65 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.13 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  30.65 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 233 aa  41.2  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>