116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2268 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2268  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  53 
 
 		 203 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  39.79 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2137  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.21 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  39.69 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.06 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  37.19 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  37.82 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2720  LysE/RhtB family amino acid efflux pump  46.53 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1378  lysine exporter protein LysE/YggA  46.53 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69101  normal  0.262549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5277  putative threonine efflux protein  35.36 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.664616  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0754  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.754673  normal  0.702985 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  32.34 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0804  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.52 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3877  LysE family amino acid efflux protein  32.85 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  35.88 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  20.92 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  20.92 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  20.92 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  20.92 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  20.92 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.83 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  20.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  20.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  27.67 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  20.92 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.23 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.04 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  20.92 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  20.92 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  26.25 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  30.68 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  30.68 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  30.68 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  30.68 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  30.68 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  30.68 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  30.68 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  25.89 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.46 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  26.34 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  26.09 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  30.46 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  25.91 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  23.64 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  26.09 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  23.03 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  30.63 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  26.09 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  20.5 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  20.5 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  24.23 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  23.22 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  26.67 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  26.92 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  27.12 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.38 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  26.92 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.2 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  25.47 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  20.3 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  29.94 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  24.06 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  24.06 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  24.06 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  24.06 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  27.52 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  28.67 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  28.67 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  29.09 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  28.07 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  25.47 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  24.06 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  25.47 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  25 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  24.06 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  24 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0514  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  25.93 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  27.52 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.06 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  30 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  24.06 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0661  lysine exporter protein LysE/YggA  26.16 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  hitchhiker  0.00312579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  26.29 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>