25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0514 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0514  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 202 aa  367  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.31 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  45.33 
 
 		 225 aa  97.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.407704  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3303  lysine exporter protein LysE/YggA  46.9 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  hitchhiker  0.000332886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.11 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.215816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  36.84 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  27.33 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  27.91 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  28.06 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6378  hypothetical protein  29.65 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.57 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  28.11 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  28.11 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5357  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4913  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3009  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>