34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4097 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 213 aa  404  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12283  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.891752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0514  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.204374  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  24.29 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0472  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.99 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.464761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.22 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.9 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.215816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3701  hypothetical protein  26.9 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.364527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  28.23 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.74 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1663  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.08 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  27.75 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  27.92 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  27.27 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  27.45 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  27.45 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  27.45 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  27.27 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  27.84 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  24.26 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  27.32 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.33 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  26.24 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  30.06 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  25.12 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>