124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3852 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3852  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 214 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  70.81 
 
 		 220 aa  288  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  61.97 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  61.03 
 
 		 217 aa  257  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  52.86 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  52.61 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  54.03 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  54.03 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  55.77 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  53.55 
 
 		 224 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  53.55 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  53.55 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  53.55 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  53.55 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  52.38 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  52.38 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  51.66 
 
 		 223 aa  197  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  51.66 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0913  lysine exporter protein LysE/YggA  52.38 
 
 		 222 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0887  homoserine/homoserine lactone/threonine efflux pump  51.82 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3107  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.58 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0613  lysine exporter protein LysE/YggA  51.15 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.42 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.12 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3289  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.81 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3421  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  26 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  23.96 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  21.88 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  21.88 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  21.88 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  23.43 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  23.43 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  23.43 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  22.86 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  24.86 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  24.86 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  24.86 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  24.86 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  24.29 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  29.14 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  23.73 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  24.61 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  22.51 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  22.51 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  25.29 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  30.43 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  23.73 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  23.16 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  27.31 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  24.71 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  25.64 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  30.43 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  29.06 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  29.06 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  29.06 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05430  putative chemotaxis protein  28.57 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  28.1 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.79 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0517  chemotactic transduction protein ChpE  27.95 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  26.04 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  29.41 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  26.29 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  29.41 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  29.41 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  29.41 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  29.41 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  29.41 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  29.41 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  30.14 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  27.65 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.08 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.46 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  30.43 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.03 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  27.87 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  28.07 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  25.4 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  28.03 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  26.25 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  24.75 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  25.84 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.37 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  27.5 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  28.47 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  24.63 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2966  hypothetical protein  26.92 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.32 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.82 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  28.47 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  29.89 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  29.31 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.38 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  27.82 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>