More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4341 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 205 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  92.2 
 
 		 242 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  71.71 
 
 		 205 aa  286  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.82 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  44.75 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  41.95 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  46.52 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  41.67 
 
 		 203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  40.72 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  41.87 
 
 		 203 aa  137  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  39.06 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  37.89 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.3 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.74 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  32.99 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  40.62 
 
 		 233 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  40.62 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  40.8 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  40.8 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  40.8 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  40.8 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  40.8 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.17 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.8 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  29.9 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2641  hypothetical protein  34.2 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.774137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.17 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  39.06 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.81 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  30.43 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  27.1 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.01 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.08 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  28.12 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  27.96 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  27.96 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  30.65 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  27.18 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  29.9 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.08 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  30.33 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  30.65 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.96 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  30.36 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.1 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  26.15 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  26.15 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.19 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  27.05 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  29.33 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  31.87 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  26.15 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  32.78 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  27.96 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  30.21 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.14 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  26.53 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  33.7 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  26.64 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  36.61 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.71 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.27 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.35 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>