41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1525 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  100 
 
 
173 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  75.82 
 
 
203 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  64.52 
 
 
203 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  66.67 
 
 
137 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  80.56 
 
 
233 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  80.56 
 
 
217 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  72.29 
 
 
203 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  72.29 
 
 
203 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  72.29 
 
 
203 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  72.29 
 
 
203 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  80.56 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  60 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  60.22 
 
 
203 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  63.44 
 
 
203 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  61.22 
 
 
203 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  43.52 
 
 
205 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  42.59 
 
 
205 aa  87.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.86 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  38.39 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 
242 aa  67.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  44.71 
 
 
212 aa  67.4  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.61 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.3 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.78 
 
 
203 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  37.35 
 
 
206 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 
207 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 
230 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
208 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 
215 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.34 
 
 
207 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 
215 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 
215 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  35.16 
 
 
205 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  38.03 
 
 
215 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 
205 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 
203 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0441  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.89 
 
 
206 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.21 
 
 
207 aa  41.2  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  30.12 
 
 
204 aa  41.2  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 
201 aa  41.2  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>