290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3890 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  100 
 
 
137 aa  268  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  86.29 
 
 
203 aa  209  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  91.13 
 
 
203 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  91.13 
 
 
203 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  75 
 
 
203 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  75.24 
 
 
233 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  75.24 
 
 
217 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  75.24 
 
 
203 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  75.24 
 
 
203 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  75.24 
 
 
203 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  75.24 
 
 
203 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  75.24 
 
 
203 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  62.9 
 
 
203 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  57.26 
 
 
203 aa  147  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  56.35 
 
 
205 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  52.38 
 
 
205 aa  133  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  66.67 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.13 
 
 
203 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.13 
 
 
203 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  37.9 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.06 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  42.28 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.06 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.8 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  40.15 
 
 
207 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  38.79 
 
 
205 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.18 
 
 
215 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  36.3 
 
 
215 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  31.2 
 
 
207 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  36.13 
 
 
203 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
206 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  34.4 
 
 
215 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  34.4 
 
 
215 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  34.4 
 
 
215 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.08 
 
 
209 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.59 
 
 
207 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  28.69 
 
 
203 aa  54.3  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 
209 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 
209 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 
210 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.73 
 
 
212 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.07 
 
 
230 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  31.45 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.91 
 
 
210 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  34.11 
 
 
212 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  32.81 
 
 
210 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.56 
 
 
211 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  33.6 
 
 
210 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.95 
 
 
216 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  28.23 
 
 
204 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  33.6 
 
 
210 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  38.33 
 
 
202 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 
203 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.25 
 
 
210 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.59 
 
 
203 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  37.61 
 
 
215 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0969  putative threonine efflux protein  25 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00708139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.56 
 
 
211 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
213 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7782  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 
202 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0822  lysine exporter protein LysE/YggA  35.51 
 
 
197 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  29.66 
 
 
213 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 
211 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.03 
 
 
288 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 
210 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.03 
 
 
210 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  29.92 
 
 
210 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 
211 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 
198 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 
200 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 
232 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 
212 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  31.62 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.65 
 
 
207 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  29.92 
 
 
211 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 
204 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
204 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.54 
 
 
207 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  33.6 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  37.39 
 
 
199 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  33.6 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 
210 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 
207 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.1 
 
 
210 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 
234 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.56 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 
211 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.93 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
210 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 
210 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  26.27 
 
 
200 aa  48.1  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 
213 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 
210 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.91 
 
 
209 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>