More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4806 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
203 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  71.43 
 
 
203 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  72.41 
 
 
203 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  71.43 
 
 
203 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  64.53 
 
 
203 aa  252  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  65.52 
 
 
203 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  73.78 
 
 
233 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  73.78 
 
 
217 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  73.78 
 
 
203 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  73.78 
 
 
203 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  73.78 
 
 
203 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  73.78 
 
 
203 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  73.78 
 
 
203 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  54.63 
 
 
205 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  52.36 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  75 
 
 
137 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.69 
 
 
242 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.2 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.87 
 
 
203 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.78 
 
 
203 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  42.58 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  75.82 
 
 
173 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  43.96 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.69 
 
 
205 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  44.75 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  32.62 
 
 
206 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  33.33 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3827  lysine exporter protein (LysE/YggA)  69.41 
 
 
93 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.87 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 
206 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  29.71 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
208 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 
203 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  32.83 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.24 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  26.53 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  35.26 
 
 
215 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  33.14 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.05 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.96 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.24 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.31 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.65 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.79 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  32.07 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.9 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.54 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.73 
 
 
288 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  31.15 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  32.8 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.79 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  30.86 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.92 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  31.49 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.78 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  30.9 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  31.49 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  32.26 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  30.34 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0441  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.29 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.35 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.72 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.72 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.1 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  33.77 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  35.37 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  31.29 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>