More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3363 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 203 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  63.9 
 
 		 205 aa  251  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  64.55 
 
 		 203 aa  246  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  63.05 
 
 		 203 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  60.21 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  59.11 
 
 		 203 aa  238  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  59.26 
 
 		 203 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  59.26 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  62.2 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  62.2 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  62.2 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  62.2 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  62.2 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  62.2 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  62.8 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.78 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.12 
 
 		 203 aa  167  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  43.84 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.86 
 
 		 242 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.87 
 
 		 205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.15 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  57.26 
 
 		 137 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  40.64 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  43.17 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  37.84 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  60.22 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  39.55 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  34.16 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.74 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3827  lysine exporter protein (LysE/YggA)  64.79 
 
 		 93 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.45 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  32.96 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  36.02 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  35.48 
 
 		 209 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  35.43 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  32.22 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.21 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.25 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.77 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  29.65 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  36.3 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.41 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  28.11 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  30.54 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.33 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  34.41 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  34.41 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  28.93 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  27.17 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  35.56 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.16 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.05 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.56 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.13 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  30.27 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.76 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.74 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.32 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.77 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  33.77 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  32.87 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  38.84 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.41 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2082  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.17 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.48 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.39 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.32 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>