More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3016 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
205 aa  400  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  88.48 
 
 
205 aa  344  7e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  56.1 
 
 
203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  63.9 
 
 
203 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  55.61 
 
 
203 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  54.63 
 
 
203 aa  197  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  57.07 
 
 
203 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  56.59 
 
 
203 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.12 
 
 
203 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.79 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.95 
 
 
205 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.95 
 
 
242 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  51.2 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  51.2 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  51.2 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  51.2 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  51.2 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  51.2 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  40.76 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  52.31 
 
 
203 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.44 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 
206 aa  141  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  52.38 
 
 
137 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  42.08 
 
 
212 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 
202 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  39.27 
 
 
206 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  34.48 
 
 
207 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.06 
 
 
230 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 
205 aa  104  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
204 aa  97.8  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.69 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3827  lysine exporter protein (LysE/YggA)  68.24 
 
 
93 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.62 
 
 
211 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  42.59 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  34.98 
 
 
206 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 
204 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  38.06 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
210 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  35 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  34.81 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.74 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  32.4 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  35 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  34.81 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  31.53 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.29 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.21 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.21 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.03 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.89 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  27.12 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.98 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.66 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  31.47 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.09 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.84 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  32.89 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.84 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.43 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  30.15 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.66 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  29.32 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.66 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  29.32 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  29.32 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.11 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  29.32 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  29.32 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.19 
 
 
205 aa  72  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.8 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.28 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  28.8 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  28.8 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>