More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4677 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
203 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  98.52 
 
 
203 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  92.12 
 
 
203 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  71.43 
 
 
203 aa  260  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  61.58 
 
 
203 aa  241  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  91.13 
 
 
137 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  56.59 
 
 
205 aa  211  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  60.1 
 
 
203 aa  209  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  54.97 
 
 
205 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  69.51 
 
 
233 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  69.51 
 
 
217 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  69.51 
 
 
203 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  69.51 
 
 
203 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  69.51 
 
 
203 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  69.51 
 
 
203 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  69.51 
 
 
203 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.87 
 
 
203 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.31 
 
 
203 aa  147  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3827  lysine exporter protein (LysE/YggA)  94.12 
 
 
93 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  45.11 
 
 
212 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  38.42 
 
 
205 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.41 
 
 
242 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 
205 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.2 
 
 
205 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  63.44 
 
 
173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.87 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  32.84 
 
 
207 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  38.3 
 
 
205 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 
204 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  33.5 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.15 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  34.38 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.15 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.86 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  25.76 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.1 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.96 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  33.13 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.98 
 
 
211 aa  72  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0969  putative threonine efflux protein  27.91 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00708139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  35.33 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.46 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.72 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.36 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.86 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.91 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.56 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  28.81 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.41 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  32.03 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.21 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.61 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  35.37 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.61 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  28.41 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  34.09 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.69 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.92 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  28.41 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  34.53 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  28.73 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.15 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.59 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.66 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>