More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1208 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  100 
 
 		 233 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  99.54 
 
 		 217 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  100 
 
 		 203 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  100 
 
 		 203 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  100 
 
 		 203 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  100 
 
 		 203 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  99.51 
 
 		 203 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  69.46 
 
 		 203 aa  275  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  73.02 
 
 		 203 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  61.08 
 
 		 203 aa  244  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  69.31 
 
 		 203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  69.31 
 
 		 203 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  54.97 
 
 		 205 aa  215  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  62.18 
 
 		 203 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  54.15 
 
 		 205 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  75 
 
 		 137 aa  187  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.32 
 
 		 203 aa  161  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.5 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  73.74 
 
 		 173 aa  141  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  41.38 
 
 		 205 aa  141  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.95 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.67 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  42.54 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.16 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.91 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  33.83 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  35.45 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  38.64 
 
 		 205 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3827  lysine exporter protein (LysE/YggA)  64.79 
 
 		 93 aa  92  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  35.27 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.13 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 202 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  34.02 
 
 		 215 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  34.02 
 
 		 215 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.18 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  39.86 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.21 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  36.84 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  36.18 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  36.18 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  31.25 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.24 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  32.73 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.77 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.73 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  26.78 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.29 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.09 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.06 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  34.64 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.48 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.7 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  34.07 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.38 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.38 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  32.94 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  34 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.48 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.99 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  28.99 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.05 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  28.99 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  28.99 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  28.99 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.87 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  28.99 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  28.99 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 		 210 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  35.34 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.79 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>