More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0005 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
203 aa  380  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  94.76 
 
 
203 aa  341  4e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  46.12 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  43.35 
 
 
203 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  43.41 
 
 
203 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  44.21 
 
 
205 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  46.63 
 
 
203 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 
203 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 
203 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  40.64 
 
 
203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  46.81 
 
 
212 aa  127  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  38.54 
 
 
205 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  45.9 
 
 
203 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  45.9 
 
 
203 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  45.9 
 
 
217 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  45.9 
 
 
203 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  45.9 
 
 
203 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  45.9 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  46.28 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  34.57 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 
205 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.26 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.92 
 
 
242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
202 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
206 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 
207 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  41.13 
 
 
137 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  41.01 
 
 
205 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  33.5 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.51 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.51 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.81 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  35 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  24.59 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.85 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.35 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.69 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  30.62 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  31.15 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  30.35 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  30.84 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.19 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  39.78 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.1 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  30.91 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.24 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  31.92 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.8 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  33.33 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  35.9 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  27.8 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  34.02 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.63 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  31.31 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.03 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  29.3 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.18 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6178  lysine exporter protein LysE/YggA  41.11 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203185  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.85 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  30.27 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  28.77 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  28.85 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  28.77 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>