More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0010 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
207 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  34.31 
 
 
205 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 
203 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.23 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.61 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
242 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  35.87 
 
 
202 aa  88.2  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
203 aa  87.8  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
205 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  33.68 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  34.95 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
203 aa  84.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  35.57 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  31.01 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  35.2 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  35.2 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  35.2 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0980  hypothetical protein  30.37 
 
 
207 aa  72  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00272416  normal  0.0487785 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  35.2 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  35.2 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  35.2 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  35.2 
 
 
233 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4486  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.46 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  26.09 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  26.09 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  31.89 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  30.66 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  28 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  26.67 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.61 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  31.91 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  31.84 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  26.09 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  31.25 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  26.09 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.9 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  31.76 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  35.4 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.53 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  31.76 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  31.18 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  40.15 
 
 
137 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  31.18 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  31.18 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  31.18 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.88 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  27.75 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.14 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  31.18 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  29.25 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  26.09 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  26.28 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.47 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  27.01 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.45 
 
 
208 aa  62  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.43 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  29.33 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.93 
 
 
208 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  28.93 
 
 
208 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  28.06 
 
 
210 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  27.96 
 
 
206 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.11 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  29.52 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.29 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  34.23 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  30.83 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  28.93 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.7 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  28.93 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  29.57 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  29.71 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  29 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.35 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>