More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4540 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
205 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  60.78 
 
 
205 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.82 
 
 
205 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.02 
 
 
242 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  49.73 
 
 
212 aa  161  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  53.19 
 
 
205 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  45.32 
 
 
202 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  41.26 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  42.44 
 
 
205 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  41.88 
 
 
205 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  45.15 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  41.27 
 
 
206 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 
203 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  35.83 
 
 
206 aa  124  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  41.67 
 
 
203 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.47 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.96 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 
203 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  38.54 
 
 
203 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  34.15 
 
 
207 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.6 
 
 
230 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 
204 aa  101  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
208 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  43.09 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  43.09 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  43.09 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  43.09 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  43.09 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  43.44 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  43.44 
 
 
233 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.99 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  35.52 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  34.97 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  34.27 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.86 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.31 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  34.1 
 
 
209 aa  88.2  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  34.22 
 
 
205 aa  84.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  37.08 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.45 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  36.47 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  34.41 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.99 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.29 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2641  hypothetical protein  32.47 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.774137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.53 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  32.1 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  37.8 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  29.95 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.24 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.68 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4486  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.35 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.5 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.73 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  30.29 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  30.29 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.29 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  30.29 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.29 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.75 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  29.73 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.29 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.29 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.46 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  28.04 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  28.82 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
205 aa  72  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6178  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203185  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.47 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.81 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.29 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.75 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.75 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  30.65 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  28.65 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.99 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.01 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>