More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0186 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  100 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  88.78 
 
 
205 aa  345  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  57.07 
 
 
203 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  53.17 
 
 
203 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  60.98 
 
 
203 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  52.36 
 
 
203 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  54.97 
 
 
203 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  54.97 
 
 
203 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  54.22 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  54.22 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  54.22 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  54.22 
 
 
217 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  54.22 
 
 
233 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  54.22 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.66 
 
 
203 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  54.62 
 
 
203 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.21 
 
 
203 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.83 
 
 
205 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.83 
 
 
242 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  40.78 
 
 
205 aa  148  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.9 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  37.63 
 
 
206 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  56.35 
 
 
137 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  41.4 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  38.62 
 
 
206 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  38.35 
 
 
202 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.04 
 
 
230 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  33.17 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  41.57 
 
 
205 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
204 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.69 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  43.52 
 
 
173 aa  92  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.62 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3827  lysine exporter protein (LysE/YggA)  59.15 
 
 
93 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  35.47 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
210 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  27.96 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.74 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.21 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.21 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  35.26 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  35.26 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  29.41 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  31.66 
 
 
213 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  35.07 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.83 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.11 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.47 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  36.43 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.15 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.41 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.88 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  29.67 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.92 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  29.28 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.39 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  29.5 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.98 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  29.31 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.35 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.17 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  28.25 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.26 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.49 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  33.1 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  28.8 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  33.1 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
220 aa  72  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.89 
 
 
207 aa  72  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>