More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0441 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0441  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 206 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  29.26 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  28.5 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0964  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0177449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.95 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  26.19 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  27.55 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  28.48 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  27.89 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  24.29 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  27.81 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  29.87 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  27.81 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  27.81 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  27.81 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  27.81 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  26.02 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  27.22 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  26.63 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  27.41 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.71 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  27.62 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.23 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.35 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  22.84 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  26.63 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04781  hypothetical protein  23.12 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05656  hypothetical protein  23.12 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  27.14 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  26.45 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.6 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  25.73 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.12 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.68 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  25.38 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  27.09 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  26.67 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.66 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  25.4 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  29.38 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  27.75 
 
 		 640 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.03 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  27.18 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.7 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.23 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  24.24 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  26.95 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  29.45 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  26.88 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  26.88 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  26.88 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  26.88 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  26.71 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  26.88 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  27.56 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  26.95 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.87 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.88 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  27.38 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  26.74 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.28 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  26.99 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  24.5 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  23.98 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  23.98 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  25.93 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.33 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  25.14 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  25.24 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  24.34 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.38 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  31.54 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.2 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.31 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0969  putative threonine efflux protein  26.76 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00708139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  24.34 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  26.88 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.01 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  24.34 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  25.62 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  26.63 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  27.98 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2299  lysine exporter protein LysE/YggA  26.9 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.691997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3717  lysine exporter protein LysE/YggA  25.32 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.838213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>