More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0822 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0822  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 197 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0272  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.63 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0577  hypothetical protein  31.52 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0313  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0254408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1658  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199082  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1462  LysE family transport protein  37.24 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0346145 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  32.08 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0280  hypothetical protein  30.43 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136172  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2583  amino acid transporter LysE  29.89 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2447  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0885  amino acid transporter LysE  29.89 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1461  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.21 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.21 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.49 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  32.62 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  30.27 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.82 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  31.93 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  31.46 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  29.73 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  28.99 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.82 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  32.73 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  29.48 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  27.22 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2135  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5811  lysine exporter protein LysE/YggA  38.52 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  30.49 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6041  lysine exporter protein LysE/YggA  38.52 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  28.16 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  29.17 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.74 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  29.57 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1055  hypothetical protein  29.94 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  29.03 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  29.78 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  28.57 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  30.72 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  25.57 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  25.41 
 
 		 640 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  28.18 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  24.58 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  25.14 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  25.14 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.14 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  25.14 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  25.14 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  31.15 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  27.62 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  24 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  24 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  24 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.4 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  27.62 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  29.21 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  24 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.69 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  23.5 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  27.03 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  27.65 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  27.65 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2133  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28.33 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  27.65 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  27.65 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  27.65 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  27.65 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  29.09 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  35.58 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  27.07 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2285  hypothetical protein  27.78 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  28.99 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  27.07 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  27.07 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  27.22 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  26.52 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>