More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0577 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0577  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2583  amino acid transporter LysE  92.89 
 
 
197 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2447  hypothetical protein  92.89 
 
 
197 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0885  amino acid transporter LysE  92.89 
 
 
197 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1461  hypothetical protein  92.89 
 
 
197 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0280  hypothetical protein  92.39 
 
 
208 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136172  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0313  hypothetical protein  92.39 
 
 
197 aa  354  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0254408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1658  hypothetical protein  92.39 
 
 
197 aa  354  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0272  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.57 
 
 
204 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0822  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 
197 aa  94  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  28.36 
 
 
640 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  30.17 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.5 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.47 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.46 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.46 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  31.67 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  30.21 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  30.17 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  29.19 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  30.23 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  28.35 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  31.49 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  26.49 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  33.87 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  29.78 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  28.8 
 
 
280 aa  72  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  31.61 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  36.89 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  30.27 
 
 
209 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  28.65 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  28.65 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  28.65 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  28.65 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  28.65 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  28.65 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  28.89 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.63 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  30.5 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  30.9 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  29.1 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  29.1 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  30.5 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  29.1 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  29.28 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  29.83 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  29.83 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.85 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  26.98 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  30.34 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  27.22 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.69 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  29.47 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  31.05 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  27.75 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  28.35 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.82 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1462  LysE family transport protein  33.6 
 
 
218 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0346145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  30 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  30.54 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2135  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 
199 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2463  lysine exporter protein LysE/YggA  28.34 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.152581 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5811  lysine exporter protein LysE/YggA  26 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6041  lysine exporter protein LysE/YggA  26 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  26.46 
 
 
198 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  28.04 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4234  hypothetical protein  28.64 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744826  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  34.57 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  32.76 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  27.71 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3726  hypothetical protein  28.42 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>