More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1690 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  100 
 
 
204 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3236  lysine exporter protein LysE/YggA  66.67 
 
 
195 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4085  lysine exporter protein LysE/YggA  66.67 
 
 
195 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4281  lysine exporter protein LysE/YggA  66.67 
 
 
195 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1731  lysine exporter protein LysE/YggA  65.2 
 
 
195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  63.73 
 
 
195 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4184  lysine exporter protein LysE/YggA  69.12 
 
 
201 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161304  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3706  lysine exporter protein LysE/YggA  69.12 
 
 
201 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2504  efflux protein, LysE family  60.71 
 
 
188 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  58.42 
 
 
193 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  58.42 
 
 
195 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0034  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.47 
 
 
195 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1384  lysine exporter protein LysE/YggA  57.98 
 
 
197 aa  201  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  52.45 
 
 
197 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2498  lysine exporter protein LysE/YggA  54.95 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0255081  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2325  lysine exporter protein LysE/YggA  55.94 
 
 
215 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3438  lysine exporter protein LysE/YggA  54.95 
 
 
193 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  39.11 
 
 
197 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  41.09 
 
 
203 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  42 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  36.76 
 
 
200 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.37 
 
 
197 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
197 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
197 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 
209 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
197 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
197 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 
201 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 
209 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 
197 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.37 
 
 
197 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 
209 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 
197 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 
197 aa  121  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 
197 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  31.22 
 
 
197 aa  121  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  36.32 
 
 
205 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 
202 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  34.83 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  37.88 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 
198 aa  111  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.41 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  36.51 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  34.72 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  33.51 
 
 
195 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 
206 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297592  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 
206 aa  104  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  32.07 
 
 
201 aa  104  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.63 
 
 
207 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 
207 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  27.86 
 
 
204 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.63 
 
 
207 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 
204 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 
196 aa  101  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 
208 aa  101  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 
205 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 
205 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 
205 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 
205 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  31.47 
 
 
194 aa  97.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  34.31 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  28.93 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.21 
 
 
197 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.21 
 
 
197 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 
200 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  31.41 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  31.41 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  31.41 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  31.41 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  31.41 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  31.41 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  30.96 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 
196 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  30.39 
 
 
201 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  30.89 
 
 
280 aa  92  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  33.68 
 
 
202 aa  91.3  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2389  lysine exporter protein LysE/YggA  31.38 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000372356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1977  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.44 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  29.08 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  31.41 
 
 
640 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2382  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>