More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2510 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2346  hypothetical protein  79.51 
 
 		 212 aa  327  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3726  hypothetical protein  40.8 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4435  lysine exporter protein LysE/YggA  43.65 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4234  hypothetical protein  46.7 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3843  hypothetical protein  40.51 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3116  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  141  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0747  hypothetical protein  42.49 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0594  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  38.14 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0361  hypothetical protein  37.3 
 
 		 189 aa  121  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3541  hypothetical protein  41.76 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000708449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  41.62 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  37.76 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  36.73 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  36.51 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  36.73 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.9 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 197 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 197 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1235  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0243337  normal  0.0393722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  31.77 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.46 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.82 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  34.64 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  39.66 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.82 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  34.81 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  36.46 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  34.95 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  35.94 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  34.36 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.39 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  33.86 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  35.38 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.92 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  33.51 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  33.5 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  33.5 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  32.52 
 
 		 280 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  33.5 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  34.87 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  33.5 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  33.5 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  33.5 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  35.08 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  31.25 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  33.33 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  33.86 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  33.5 
 
 		 640 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3106  hypothetical protein  32.63 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.61 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.05 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  32.12 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  27.72 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  36.8 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>