More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0747 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0747  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  380  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3843  hypothetical protein  74.23 
 
 		 199 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3116  hypothetical protein  73.71 
 
 		 199 aa  277  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3726  hypothetical protein  64 
 
 		 203 aa  246  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4435  lysine exporter protein LysE/YggA  71.27 
 
 		 199 aa  238  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4234  hypothetical protein  67.66 
 
 		 203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0594  lysine exporter protein LysE/YggA  62.7 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3541  hypothetical protein  62.5 
 
 		 198 aa  197  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000708449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0361  hypothetical protein  56.68 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2346  hypothetical protein  43.23 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  42.49 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  31.72 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2253  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  37.63 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2480  amino acid transporter LysE  31.72 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00208965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2196  amino acid transporter LysE  30.65 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  31.18 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.91 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  30.11 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2278  amino acid transporter LysE  30.11 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0428766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2238  amino acid transporter LysE  30.11 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00601347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  30.11 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  30.2 
 
 		 640 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  35.32 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  28.11 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.85 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.96 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  28.79 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.85 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.29 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0034  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.96 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  26.56 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.86 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  26.94 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  31.61 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  31.61 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  30.15 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  33.71 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.49 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  25.68 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.13 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  28.72 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  30.2 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  30.2 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  30.2 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  30.2 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  30.2 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  28.72 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  30.2 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  30.18 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  25.68 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  26.78 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  24.61 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  24.08 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  29.73 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  27.37 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  33.12 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  29.73 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.61 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  30.77 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2731  neutral amino-acid efflux protein  30.05 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0764776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  26.74 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3815  neutral amino-acid efflux protein  29.51 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.799014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  28.42 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1090  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.05 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0625608  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  28.71 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2735  neutral amino-acid efflux protein  30.05 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00799309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1099  neutral amino-acid efflux protein  30.05 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0442418  normal  0.231568 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2958  neutral amino-acid efflux protein  30.05 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.34 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>