More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1041 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  56.25 
 
 		 204 aa  218  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  58.85 
 
 		 199 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  58.33 
 
 		 194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  51.04 
 
 		 197 aa  197  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 196 aa  195  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  53.37 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  47.92 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  50.26 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  48.44 
 
 		 197 aa  178  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  48.7 
 
 		 202 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  51.06 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  53.07 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  45.13 
 
 		 640 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  46.24 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  45.64 
 
 		 280 aa  167  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  46.03 
 
 		 197 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  42.47 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  45.31 
 
 		 200 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  44.97 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  45.83 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  46.03 
 
 		 197 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  46.03 
 
 		 197 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.5 
 
 		 197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  45.36 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  45.13 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  45.13 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  45.13 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  45.13 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  45.13 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  45.13 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  49.16 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  44.1 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  45.51 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  45.6 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  46.28 
 
 		 209 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  43.39 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  43.08 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  45.74 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  44.1 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  41.88 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  45.74 
 
 		 209 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  43.08 
 
 		 205 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.35 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  43.08 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  46.88 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  41.67 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  43.98 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.19 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  42.56 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  42.56 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.83 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  40.84 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  42.13 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  46.81 
 
 		 198 aa  151  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  41.8 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  42.78 
 
 		 198 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  45.05 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  42.33 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  40.21 
 
 		 197 aa  144  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  44.1 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  41.33 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  43.11 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.1 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1055  hypothetical protein  36.17 
 
 		 200 aa  131  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 201 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.86 
 
 		 201 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1731  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3106  hypothetical protein  36.21 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  35.03 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  35.03 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.63 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3236  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 		 202 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4085  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4281  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1977  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.13 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  32.62 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  30.32 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2370  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2382  lysine exporter protein LysE/YggA  38.59 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  38.59 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107691  decreased coverage  0.0000842589 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  31.18 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  30.32 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2133  lysine exporter protein (LysE/YggA)  39.55 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  35.15 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>