More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3162 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 201 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  63.78 
 
 		 197 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  62.18 
 
 		 196 aa  229  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  59.8 
 
 		 200 aa  216  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  56.06 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  56.85 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  54.04 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  53.73 
 
 		 205 aa  207  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  54.82 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  56.41 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  55.38 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  55.38 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  58.08 
 
 		 198 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  50 
 
 		 640 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  55.56 
 
 		 225 aa  200  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  52.02 
 
 		 199 aa  198  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  56.35 
 
 		 196 aa  197  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  56.06 
 
 		 202 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  53.27 
 
 		 197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  55.33 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  54.55 
 
 		 204 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  50.99 
 
 		 205 aa  191  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  53.37 
 
 		 195 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  50.99 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  51.49 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.53 
 
 		 197 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  48.99 
 
 		 197 aa  188  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  50.25 
 
 		 204 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  50.99 
 
 		 205 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  53.3 
 
 		 199 aa  187  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  47.98 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  50.79 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.02 
 
 		 197 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  50.5 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  50.5 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  47.47 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  47.47 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  47.98 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  46.97 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  50.75 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.24 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  46.97 
 
 		 197 aa  184  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  50 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  50 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  50 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  50 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  50 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  50 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  46.46 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  47.72 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  46.97 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  46.97 
 
 		 197 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.46 
 
 		 197 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  49.75 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  46.46 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  46.97 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  57.87 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  49.51 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  51.52 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  49.75 
 
 		 197 aa  174  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  47.21 
 
 		 197 aa  174  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  47.24 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  47.72 
 
 		 201 aa  160  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  39.59 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  42.65 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  46.94 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  42.64 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  43.23 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  42.56 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  40.61 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  38.58 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1055  hypothetical protein  42.33 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  41.75 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  41.71 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  47.09 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2382  lysine exporter protein LysE/YggA  41.12 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1977  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.12 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  41.12 
 
 		 220 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107691  decreased coverage  0.0000842589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2370  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 220 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2133  lysine exporter protein (LysE/YggA)  39.59 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  36.84 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  35.79 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.42 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3106  hypothetical protein  40.22 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.93 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  33.69 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  38.58 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.9 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  35.47 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  35.47 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  31.75 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2498  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0255081  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2285  hypothetical protein  36.55 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>