More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2285 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2285  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  92.79 
 
 		 208 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  92.79 
 
 		 208 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2370  lysine exporter protein LysE/YggA  83.65 
 
 		 220 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  82.69 
 
 		 220 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107691  decreased coverage  0.0000842589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1977  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  82.69 
 
 		 208 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2382  lysine exporter protein LysE/YggA  82.21 
 
 		 220 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1834  lysine exporter protein LysE/YggA  92.79 
 
 		 208 aa  341  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.438824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2133  lysine exporter protein (LysE/YggA)  82.69 
 
 		 208 aa  332  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  64.18 
 
 		 202 aa  275  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  64.14 
 
 		 201 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  63.4 
 
 		 202 aa  221  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  40.72 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  39.9 
 
 		 640 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  42.33 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  36.04 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.58 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  37.56 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.55 
 
 		 197 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  39.06 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  34.54 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  40.53 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  42.62 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  40.45 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  38.25 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  40.98 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  40.84 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  36.6 
 
 		 197 aa  131  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  40.98 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  40.74 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  40.74 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  40.74 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  40.74 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  40.74 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  40.74 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  37.7 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 		 205 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  37.7 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  41.05 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  37.7 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  40.44 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  40.21 
 
 		 280 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  40.44 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 196 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  41.27 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  36.57 
 
 		 212 aa  124  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  40.74 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  37.99 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  37.95 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  40.11 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  36.92 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  37.43 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  38.98 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1055  hypothetical protein  37.29 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  36.16 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  41.84 
 
 		 197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.33 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  38.5 
 
 		 198 aa  111  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  35.75 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  37.89 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.36 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  40.12 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  39.36 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.79 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  35.29 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  35.29 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  37.78 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0243337  normal  0.0393722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  31.15 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  28.28 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>