More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3854 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
197 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  51.6 
 
 
204 aa  186  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  49.22 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1731  lysine exporter protein LysE/YggA  50.26 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3236  lysine exporter protein LysE/YggA  49.74 
 
 
195 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4085  lysine exporter protein LysE/YggA  49.74 
 
 
195 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4281  lysine exporter protein LysE/YggA  49.74 
 
 
195 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0034  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.28 
 
 
195 aa  177  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  52.06 
 
 
193 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  51.03 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2498  lysine exporter protein LysE/YggA  50.77 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0255081  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2325  lysine exporter protein LysE/YggA  52.58 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3438  lysine exporter protein LysE/YggA  51.55 
 
 
193 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3706  lysine exporter protein LysE/YggA  49.75 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4184  lysine exporter protein LysE/YggA  49.25 
 
 
201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161304  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1384  lysine exporter protein LysE/YggA  50.84 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2504  efflux protein, LysE family  47.34 
 
 
188 aa  158  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  41.54 
 
 
203 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  42.21 
 
 
203 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  37.82 
 
 
197 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  34.01 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 
203 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  33.68 
 
 
197 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  37.06 
 
 
209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.81 
 
 
216 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  35.42 
 
 
205 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  35.42 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  37.97 
 
 
209 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  37.97 
 
 
209 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 
197 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 
199 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 
209 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
225 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
197 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
202 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
197 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.05 
 
 
197 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  35.91 
 
 
212 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
197 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
197 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
197 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 
197 aa  104  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
197 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
197 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  28.12 
 
 
197 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  30.32 
 
 
197 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 
207 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  34.59 
 
 
202 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  34.08 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  31.52 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  34.09 
 
 
208 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  34.41 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  32.96 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  32.96 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  32.96 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  30.27 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  32.96 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.52 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  32.8 
 
 
199 aa  91.7  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.9 
 
 
207 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.02 
 
 
207 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  30.73 
 
 
195 aa  88.2  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  29.5 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1055  hypothetical protein  30.27 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  32.04 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  32.6 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  32.61 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  32.61 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  32.61 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  32.61 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  32.61 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  32.61 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  33.7 
 
 
280 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  29.74 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1977  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.08 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2382  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107691  decreased coverage  0.0000842589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  31.89 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2370  lysine exporter protein LysE/YggA  33.14 
 
 
220 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>