More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0720 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  46.19 
 
 		 202 aa  187  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2389  lysine exporter protein LysE/YggA  48.31 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2238  hypothetical protein  48.07 
 
 		 197 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26340  hypothetical protein  45.3 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.56622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3069  lysine exporter protein LysE/YggA  42.56 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2074  lysine exporter protein LysE/YggA  45.64 
 
 		 194 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3266  lysine exporter protein LysE/YggA  44.62 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.64518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2429  lysine exporter protein LysE/YggA  45.13 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.716497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  32.24 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.05 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.15 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 		 211 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  28.88 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  28.73 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  30.27 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  30.27 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3106  hypothetical protein  31.52 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  31.89 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  26.74 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  28.95 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  28.95 
 
 		 205 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  29.73 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  31.29 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1235  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0243337  normal  0.0393722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.19 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  25.79 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  28.11 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.65 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  28.11 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  29.51 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  32.96 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.42 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  29.38 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  29.38 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  29.38 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  29.38 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  29.38 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  29.38 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1384  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 		 197 aa  88.2  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  28.81 
 
 		 280 aa  87.8  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  29.79 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  26.51 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4085  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4281  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2504  efflux protein, LysE family  30.9 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  27.07 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.09 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.21 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  30.11 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1731  lysine exporter protein LysE/YggA  31.87 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  26.84 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  28.25 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3236  lysine exporter protein LysE/YggA  31.32 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  29.38 
 
 		 640 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2498  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0255081  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.28 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  28.48 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  25 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1977  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.87 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  26.15 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.11 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>