More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1731 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1731  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
195 aa  377  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3236  lysine exporter protein LysE/YggA  97.44 
 
 
195 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4085  lysine exporter protein LysE/YggA  96.92 
 
 
195 aa  345  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4281  lysine exporter protein LysE/YggA  96.92 
 
 
195 aa  345  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  88.72 
 
 
195 aa  314  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4184  lysine exporter protein LysE/YggA  91.04 
 
 
201 aa  307  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161304  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3706  lysine exporter protein LysE/YggA  90.55 
 
 
201 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  62.23 
 
 
204 aa  218  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  62.18 
 
 
195 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0034  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.64 
 
 
195 aa  214  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2504  efflux protein, LysE family  61.5 
 
 
188 aa  208  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1384  lysine exporter protein LysE/YggA  62.01 
 
 
197 aa  208  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2498  lysine exporter protein LysE/YggA  59.07 
 
 
199 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0255081  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  58.55 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  50.26 
 
 
197 aa  191  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2325  lysine exporter protein LysE/YggA  59.59 
 
 
215 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3438  lysine exporter protein LysE/YggA  58.55 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  36.27 
 
 
197 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  36.79 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  36.41 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  34.9 
 
 
197 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  40.82 
 
 
209 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  35.03 
 
 
200 aa  120  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  37.95 
 
 
209 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 
209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  34.2 
 
 
197 aa  118  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
197 aa  118  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  35.05 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.2 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 
203 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 
207 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  35.08 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  35.6 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  35.6 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
196 aa  108  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  36.81 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  34.22 
 
 
195 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  38.12 
 
 
212 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  35.57 
 
 
196 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 
205 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  34.27 
 
 
202 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.36 
 
 
207 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 
208 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.81 
 
 
207 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
204 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  36.31 
 
 
205 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  34.55 
 
 
201 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 
197 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
205 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
206 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  34.21 
 
 
197 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  36.31 
 
 
205 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  36.31 
 
 
205 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  36.31 
 
 
205 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  36.31 
 
 
205 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  36.31 
 
 
205 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  36.31 
 
 
205 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 
205 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  35.39 
 
 
280 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
202 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 
199 aa  98.2  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  31.46 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  34.64 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  34.64 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 
225 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  36.31 
 
 
640 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 
216 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  30.56 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.87 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 
208 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  34.57 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
198 aa  85.5  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  29.44 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.47 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.98 
 
 
197 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
200 aa  84.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
202 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297592  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  26.46 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  27.23 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  35.05 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  33.17 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  27.23 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  27.23 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>